Episomtyper og deres egenskaper



en episoma, i feltet av genetikk, er det et DNA-molekyl som er i stand til å replikere autonomt i cytoplasmaet til vertscellen, og fysisk integrert i kromosomet er det også replikeres som en enkelt molekyl (som vi kaller I kointegrat ).

Episene kan derfor tolkes som en måte for sameksistens, og ikke som en type replikon. Faktisk er noen forfattere, transposoner og innføringssekvenser kan betraktes som episomer som det effektivt blir båret i kromosomet av vertscellen, men aldri har et selvstendig og uavhengig eksistens i cytoplasma.

I eukaryotiske celler, tvert imot, refererer episom mer til virale replikoner som sameksisterer som plasmider i infiserte celler enn til virus som kan integreres i genomet til vertscellen.

Dette er ikke det eneste tilfellet der det samme ordet betyr forskjellige ting i eukaryoter og prokaryoter (for eksempel begrepet transformasjon). Episomer har en rik historie i utviklingen av moderne genetikk, da de bidro til å løse interessante fenomen relatert til arv.

index

  • 1 Episomer som er bakteriofager
  • 2 Episomer som er plasmider
  • 3 Episomer i eukaryotiske celler
  • 4 konklusjoner
  • 5 referanser

Episomer som er bakteriofager

Et av de klassiske eksemplene på episomer er bakteriofagen lambda i vertsbakterien, den mest kjente som er Escherichia coli. En bakteriofag (forkortet fag) er et virus som infiserer bakterier.

Under betingelser som fører til smitte av bakterier ved fagen, det virale genomet i cytoplasma innført som et lineært molekyl kan sirkularisere, og stedsspesifikk rekombinasjon, integreres inn i kromosomet av vertsbakterien.

Innenfor faggenomet er det en kort sekvens av nukleotider (attλ) som er perfekt komplementær til et bindingssted (vedlegg) i bakteriens sirkulære kromosom (attB).

Rekombinationshendelsen mellom disse to stedene fører til dannelsen av et kointegrat mellom to sirkler som gir opphav til en større sirkel. Når bakteriens kromosom blir replisert, blir genomet av viruset derfor replikert (i en episomestat).

Dette kan skje for endeløse generasjoner med mindre en induktiv hendelse som fører til utkuttingen av det virale genom, og påfølgende inntreden i den autonome replikasjonssyklus av viruset som kulminerer med lysis av bakteriene for å frigi de nye virioner som genereres.

Episomer som er plasmider

En annen mest kjente eksemplene på episomer er fruktbarhet faktor eller plasmid F. noen ganger, avhengig av nukleotid oppbyggingen av vertsbakterier (f.eks E. coli), rekombinerer de seg sirkulært plasmid med homologe områder som er tilstede på kromosom av bakteriene som gir opphav til et cointegrate.

Det vil si at plasmidet kan replikere i lavkopi-nummer i bakteriens cytoplasma, eller hvis det er integrert, replikere som en helhet i et antall kopier som svarer til det for bakteriene uten F (vanligvis en).

I sin status som en episode gir F bakteriene muligheten til å produsere et høyt antall rekombinanter etter konjugeringsprosessen.

En bakterie F + (dvs. som har et plasmid F autonom) opplever å sette inn dette element er sagt å være Hfr (høy frekvens rekombinasjon for kort engelsk), som for en hendelse konjugasjon, er det teoretisk stand til å "dra" den hele bakterielle kromosomet ved en F-bakterier (dvs. som mangler fruktbarhet faktor eller plasmid F).

Generelt sekvenser som gir homologi (og følgelig likhet og komplementaritet) mellom F-plasmidet og det bakterielle kromosom for sete-spesifikk rekombinasjon prosess som gir opphav til kointegrert verifisering er innsettingssekvenser.

Episomer i eukaryotiske celler

Av historiske årsaker var begrepet episom (over + kropp) alltid knyttet til plasmidets, som opprinnelig kommer fra verdens ekstrakromosomale elementer i prokaryoter.

For å finne lignende elementer i eukaryoter anvendelsen herav er tatt i bruk for å betegne molekyler genomene til virus som er i stand til selv i denne typen av infiserte celler som lignet egenskapene av plasmidene i prokaryote.

Det vil si, i infiserte eukaryotiske celler med virus kan bli funnet i noen tilfeller, som en del av sin replikative syklus viruset eksistere i cellen som et DNA-molekyl slik disse sirkulær andre replikoner som er beskrevet, for eksempel bakterier.

De mest kjente virusene som kan sameksistere som sirkulære DNA-molekyler med autonom replikasjon (fra vertschromosomet) tilhører familiene Herpesviridae, Adenoviridae og Polyomaviridae.

Ingen av dem, men er integrert i genomet hospedador- grunnen kan anses å gjenskape som plasmider som ikke oppfyller den iboende kvaliteten som kjennetegner en episom: integreres i vertsgenomet.

Selv om eliminering av begrepet har blitt foreslått, kan dette bare legge til forvirring til et emne som allerede er ganske komplisert av seg selv..

konklusjoner

Kort sagt kan vi si at et episom, etymologisk sett, er et genetisk element i autonom replikasjon som kan eksistere i cellen som et fritt DNA-molekyl eller fysisk integrert med verten.

Fra synspunktet til genetikk, er imidlertid et episom et plasmid eller et virus som kan integrere i genomet av prokaryot eller være en av de typer plasmider som kan inneholde en eukaryot celle.

Interessant, virus som kan settes inn i genomet av eukaryotiske verten (retrovirus), anses ikke for episomer.

referanser

  1. Brock, T. D. 1990. Oppkomsten av bakteriell genetikk. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, MA, USA.
  2. Griffiths, A.J.F., Wessler, S.R., Carroll, S. B. & Doebley, J. Introduksjon til genetisk analyse. W. H. Freeman & Co, McMillan Publishers. London, Storbritannia.
  3. Hayes, W. 1971. Genetikk av bakterier og deres virus, andre utgave. Blackwell Scientific Publications.
  4. Jacob, F. & Wollman, E. L. 1958. Les épisomes, elements génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154-156.
  5. Levy, J. A., Fraenkel-Conrat, H. & Owens, O. S. 1994. Virology, 3rd Edition. Prentice Hall. Englerwood Cliffs, NJ, USA.